SV650Sは、ネイキッドスタイルのSV650と対になる、ハーフフェアリング装備のVツインスポーツだった。1999年に、日本国内で販売されたのち、国内絶版になった後も、海外市場向けに販売された。一貫して搭載されたのは、排気量645ccの水冷4スト90°V型2気筒エンジンで、アルミ製のトラスフレームが採用されていた。なお、ネイキッドスタイルのSV650と異なるのは、フェアリングのほか、低い位置にマウントされたセパレートハンドルを採用していたこと。実用性と運動性、そしてコストパフォーマンスのすべてを高いレベルで両立するスタンダードモデルだった。なお、日本で発売されたSV400S(1999-2005年)は、排気量違いの姉妹モデル。