モトクロスレーサーのCR85Rは、2003年モデルとして新登場した(2002年10月発売)。前身のCR80Rから、外観イメージを一新するとともに、エンジン排気量を拡大して、ニューモデルとしてリスタートしたかたちだった。搭載したのは、排気量84.7ccの水冷2スト単気筒で、この排気量から26.1psの高出力を発揮していた。また、CR80R時代と同様に、ホイールサイズの大小で2モデルをラインナップ。フロント17インチ/リア14インチのCR85Rと、大径(F19/R16インチ)のCR85R2が存在した。2005年モデルでのマイナーチェンジでは、デジタル点火の採用やキャブレターの変更などを受けた。2007年モデルまで設定され、同じ年に、後継車となるCRF150R/R2(4スト)が登場した。※CRシリーズは競技専用車両のため、ナンバー取得、公道での走行はできない