開発コンセプトから、「スーパーXR」とも呼ばれるXR250(MD30)。XLR250Rを継ぐかたちで1995年に登場(同時にXRバハもデビュー)し、数次のマイナーチェンジ、2003年にはタンクシュラウドが追加されるなど見た目も大きく変わったフルモデルチェンジを受けながら、2007年モデルまで生産された。生産終了の要因は、当時の排出ガス規制によるもの。モデル後半期を、XR230と棲み分け、XR230はXR250終了後も生産されていたが、やがてカタログ落ち。ホンダの公道用オフロードバイクは、2012年発売のCRF250Lまで待たねばならなかった。